Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms