Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PROB1E7EW31 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PROB1E7EW31 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms