Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms