Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms