Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms