Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms