Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms