Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms