Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F8A0AVK6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms