Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SERPINB11-209ENST00000624518 573 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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