Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms