Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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