Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TMPOP42166 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TMPOP42166 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TMPOP42166 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms