Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.2 ms