Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms