Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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