Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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