Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK6-201ENST00000325630 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1296-201ENST00000408136 92 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-IT1-201ENST00000423329 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01883-201ENST00000457385 380 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OVCH1-AS1-201ENST00000549411 743 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02295-201ENST00000557072 374 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC005552.1-201ENST00000577556 662 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM1P3-201ENST00000582370 599 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC116050.1-201ENST00000609777 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.44-201ENST00000615037 294 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL513318.2-201ENST00000602579 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ASAP1-IT2-201ENST00000626977 2031 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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