Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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