Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BGRL2Q9UJC5 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BGRL2Q9UJC5 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BGRL2Q9UJC5 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BGRL2Q9UJC5 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BGRL2Q9UJC5 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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