Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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TRIM71Q2Q1W2 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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TRIM71Q2Q1W2 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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TRIM71Q2Q1W2 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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