Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EFNB3Q15768 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms