Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HTR4Q13639 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms