Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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