Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms