Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NF1P7-201ENST00000612076 1530 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms