Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SKP22-201ENST00000365097 293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 APOM-202ENST00000375918 922 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TRBV3-1-201ENST00000390387 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 BMP2KL-201ENST00000414251 1225 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SNRPCP1-201ENST00000433292 458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GNGT2-203ENST00000507680 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GNGT2-206ENST00000515635 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GLYATL1P3-201ENST00000527482 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP001999.3-201ENST00000529922 455 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 C12orf73-203ENST00000546540 590 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP006545.1-201ENST00000563059 911 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SL457P-201ENST00000578760 287 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01764-201ENST00000587970 380 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL080285.2-201ENST00000612765 458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CDK2AP2P1-201ENST00000617479 328 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 AC104619.3-201ENST00000509116 1387 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 ZNF432-201ENST00000221315 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CNFN-201ENST00000222032 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NBR1Q14596 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms