Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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