Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RAB23Q9ULC3 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms