Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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