Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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