Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SRD5A3-AS1-212ENST00000601433 754 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL353611.1-201ENST00000417054 462 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms