Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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