Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms