Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS2Q9Y248 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS2Q9Y248 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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