Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms