Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms