Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms