Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms