Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms