Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHIC2Q9UKJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms