Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms