Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms