Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms