Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms