Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms