Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms