Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP1Q9NZI2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms