Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D2Q9NY47 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms