Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms